As unidades de conservação municipais totalizam 102,2 ha, estando a maioria delas localizadas em áreas urbanas. Devido a sua pouca representatividade na conservação da biodiversidade regional, não foram somadas na área total protegida da Bacia. Sua maior importância está relacionada à manutenção da qualidade ambiental das áreas urbanas.
A tabela 3 apresenta a relação das unidades de conservação municipais encontradas na Bacia do Taquari-Antas.
| Unidade de Conservação |
Municípios |
Área (ha) |
| Reserva Biológica do Planalto |
Farroupilha |
2,6 |
| Reserva Ecológica Parque dos Pinheiros |
Farroupilha |
10,4 |
| Floresta Municipal Nova Prata |
Nova Prata |
6,2 |
| Parque Municipal de Lajeado |
Lajeado |
25,0 |
| Parque Municipal Antônio Prado |
Antônio Prado |
20,0 |
| Parque da Rec. Santa Rita |
Farroupilha |
25,0 |
| Fundação Ecológica Cultural e Social Guabijuense |
Guabiju |
13,0 |
| Total |
|
102,2 |
O mapa constante no Anexo 2 apresenta a localização da Reserva da Biosfera da Mata Atlântica e das unidades de conservação existentes.
Os diversos habitats existentes na Bacia permitem inferir a importância desta região para a conservação da fauna, especialmente de mamíferos, aves e peixes. Dos poucos levantamentos já efetuados das espécies de mamíferos, tem-se o registro de várias espécies ameaçadas, como o puma (Puma concolor), o-gato-do-mato-pequeno (Leopardo tigrinus), o veado (Mazama sp.) e a lontra (Lutra longicaudis).
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